Muškátový ořech má velmi výraznou a osvěžující vůni. Jeho chuť je vysoce aromatická a lehce nahořklá. Používá se nejčastěji do masových směsí, do polévek a sýrových pokrmů (fondue). V Itálii je velmi oblíben na přípravu těstovin, například plněných raviol a lasagní. Muškátový ořech přidávejte do pokrmu vždy až na závěr vaření. Delší tepelnou úpravou totiž ztrácí chuť a aroma.